Η εφαρμογή του νέου ευρωπαϊκού συστήματος εισόδου-εξόδου (EES) έχει φέρει σημαντικές αλλαγές στα ταξίδια προς και από την Ευρώπη, με αποτέλεσμα οι επιβάτες να αντιμετωπίζουν αυξημένους χρόνους αναμονής και μεγάλες ουρές σε πολλά αεροδρόμια και συνοριακά σημεία. Η κατάσταση αυτή έχει προκαλέσει ανησυχία, καθώς οι αεροπορικές εταιρείες προτείνουν στους επιβάτες να φτάνουν έως και τρεις ώρες πριν από την αναχώρηση των πτήσεών τους.
Το νέο σύστημα της Ευρωπαϊκής Ένωσης αντικαθιστά τις παραδοσιακές σφραγίδες στα διαβατήρια με ψηφιακή καταγραφή των ταξιδιωτών. Για τους πολίτες εκτός ΕΕ, προβλέπονται βιομετρικοί έλεγχοι κατά την είσοδο και έξοδο από τις χώρες που συμμετέχουν στο σύστημα, γεγονός που έχει επιμηκύνει σημαντικά τους χρόνους διέλευσης. Η επικεφαλής της Wizz Air, Ιβόν Μόινιχαν, δήλωσε στο BBC ότι οι επιβάτες θα πρέπει να υπολογίζουν επιπλέον χρόνο για τους νέους ελέγχους.
Σύμφωνα με την Airports Council International Europe, οι ουρές σε ορισμένα αεροδρόμια της Ευρωπαϊκής Ένωσης φτάνουν τις 3,5 ώρες κατά τις ώρες αιχμής, με την κατάσταση να έχει επιδεινωθεί τις τελευταίες εβδομάδες. Προβλήματα παρατηρούνται και σε αεροδρόμια που μέχρι πρόσφατα λειτουργούσαν χωρίς καθυστερήσεις, όπως το λιμάνι του Ντόβερ στη Βρετανία, όπου οι γαλλικές αρχές αναγκάστηκαν να χαλαρώσουν τους ελέγχους για να αντιμετωπίσουν τις πολύωρες ουρές χιλιάδων ταξιδιωτών.
Η Ελλάδα συμμετέχει στο νέο σύστημα, αν και μέχρι στιγμής δεν έχουν αναφερθεί ακραία φαινόμενα στα ελληνικά αεροδρόμια. Οι αρμόδιες αρχές και οι αεροπορικές εταιρείες παρακολουθούν στενά την κατάσταση, καθώς η τουριστική περίοδος κορυφώνεται. Η Ευρωπαϊκή Επιτροπή υποστηρίζει ότι η διαδικασία καταχώρισης διαρκεί περίπου ένα λεπτό και ότι οι καθυστερήσεις δεν οφείλονται αποκλειστικά στο νέο σύστημα. Ωστόσο, καθώς η ταξιδιωτική κίνηση αυξάνεται το καλοκαίρι, οι νέοι έλεγχοι αναμένονται να αποτελέσουν πρόκληση για επιβάτες και αεροδρόμια σε ολόκληρη την Ευρώπη.
